高温灭菌法是采用钢制压力锅，将感染性废弃物放入锅中再以蒸汽杀菌。由于废弃物是以塑料袋包装，故采用之蒸汽必须控制在135℃以上并保持30分钟以上方能确保灭菌之效果。经灭菌后再送往掩埋场以土掩盖处理，或再送往大型焚化厂焚化减容并回收热能。
    高温高压灭菌方法：
    1.以高温蒸汽破坏微生物及病菌体内机制，制止其活性及病菌之传播。
    2.以传导方式加热锅内废弃物，故以温度，时间控制灭菌效果。
    3.以真空抽气减少空气阻力并可缩减体积便于后续处理。
    4.以蒸汽真空发生器将灭菌前，后之锅内空气或蒸汽抽出，并能定时自动注入除臭剂于锅内，达到除臭
    功能。
    5.灭菌过程之管理。
    虽然焚化炉之处理效率高，可减少后续掩埋场之使用，惟其投资成本、操作维修、保养成本均高出高温灭菌锅甚多，且所需土地面积也较大，燃烧后所排放之废气纵使符合现在之环保法规标准，惟仍对四周环境造成若干影响，若处理量不大时，建议以高温灭菌锅方式处理较为经济与便利，并符合环境与卫生条件与水准。